Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRPC3Q13507 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
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