Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FOXE3Q13461 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXE3Q13461 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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