Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ATMQ13315 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ATMQ13315 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATMQ13315 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATMQ13315 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATMQ13315 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ATMQ13315 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ATMQ13315 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATMQ13315 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATMQ13315 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATMQ13315 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ATMQ13315 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATMQ13315 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATMQ13315 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ATMQ13315 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATMQ13315 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATMQ13315 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATMQ13315 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATMQ13315 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATMQ13315 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATMQ13315 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATMQ13315 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATMQ13315 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATMQ13315 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATMQ13315 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATMQ13315 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATMQ13315 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATMQ13315 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATMQ13315 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATMQ13315 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATMQ13315 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATMQ13315 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATMQ13315 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATMQ13315 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATMQ13315 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
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