Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC37.22■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN2BQ13224 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
GRIN2BQ13224 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GRIN2BQ13224 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
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