Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MRPL28Q13084 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MRPL28Q13084 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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