Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NFX1Q12986 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
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