Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXC1Q12948 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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FOXC1Q12948 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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FOXC1Q12948 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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FOXC1Q12948 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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FOXC1Q12948 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FOXC1Q12948 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FOXC1Q12948 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FOXC1Q12948 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FOXC1Q12948 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
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