Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EFEMP1Q12805 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EFEMP1Q12805 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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