Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 HRT3YLR097C 1035 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 MRPL39YML009C 213 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 PDX3YBR035C 687 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 TUB3YML124C 1338 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 ZRC1YMR243C 1329 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 RRB1YMR131C 1536 nt4.6□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 NUR1YDL089W 1455 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 SHR3YDL212W 633 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 YDR282CYDR282C 1245 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 MPS3YJL019W 2049 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 IKS1YJL057C 2004 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 AIM23YJL131C 1071 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 YLR326WYLR326W 723 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 CRT10YOL063C 2874 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 THI80YOR143C 960 nt4.59□□□□□ -1.67
UBX3Q12229 MDL1YLR188W 2088 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 CAF4YKR036C 1932 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 PTM1YKL039W 1572 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 PTC1YDL006W 846 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 RMR1YGL250W 726 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 POP6YGR030C 477 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 DAM1YGR113W 1032 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 NMA1YLR328W 1206 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 TPP1YMR156C 717 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 SAP30YMR263W 606 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 RCE1YMR274C 948 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 AAH1YNL141W 1044 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 AIF1YNR074C 1137 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YOL162WYOL162W 648 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 SWI3YJL176C 2478 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 RGP1YDR137W 1992 nt4.58□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 GAS2YLR343W 1668 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 TYW1YPL207W 2433 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YHL012WYHL012W 1482 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 GAS4YOL132W 1416 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 RRP14YKL082C 1305 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 SBE2YDR351W 2595 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 snR63snR63 255 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YDL027CYDL027C 1263 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 RPC53YDL150W 1269 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 SNO1YMR095C 675 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ERG29YMR134W 714 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YIF1YNL263C 945 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ATG29YPL166W 642 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 KGD1YIL125W 3045 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 EUG1YDR518W 1554 nt4.57□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 RAD28YDR030C 1521 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 HFA1YMR207C 6372 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 CUS1YMR240C 1311 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 RRG1YDR065W 1098 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 GEP7YGL057C 864 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ECT1YGR007W 972 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YIL163CYIL163C 354 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 CSI1YMR025W 888 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 MRP21YBL090W 534 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ATG14YBR128C 1035 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YBR292CYBR292C 372 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 TGL1YKL140W 1647 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 BLM10YFL007W 6432 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 TGL4YKR089C 2733 nt4.56□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ABF1YKL112W 2196 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 POL12YBL035C 2118 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 GGA1YDR358W 1674 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 SUR2YDR297W 1050 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YER084WYER084W 387 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 DSD1YGL196W 1287 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YGR269WYGR269W 327 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 CYC1YJR048W 330 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 LTO1YNL260C 597 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 MGR2YPL098C 342 nt4.55□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ATM1YMR301C 2073 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ARF2YDL137W 546 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 CLC1YGR167W 702 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 IMP3YHR148W 552 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 TEF4YKL081W 1239 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 EBP2YKL172W 1284 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 CPR6YLR216C 1116 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 URA4YLR420W 1095 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YBL036CYBL036C 774 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 UMP1YBR173C 447 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 MCM2YBL023C 2607 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YND1YER005W 1893 nt4.54□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ORC6YHR118C 1308 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 PRM1YNL279W 1986 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 PGM2YMR105C 1710 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 LAC1YKL008C 1257 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 MRT4YKL009W 711 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YAL064WYAL064W 285 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ECM15YBL001C 315 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ATG33YLR356W 594 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 ATG16YMR159C 453 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YMR315WYMR315W 1050 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 PHO12YHR215W 1404 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 PHO11YAR071W 1404 nt4.53□□□□□ -1.68
UBX3Q12229 BOP2YLR267W 1713 nt4.52□□□□□ -1.69
UBX3Q12229 TFC7YOR110W 1308 nt4.52□□□□□ -1.69
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