Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 NMD4YLR363C 657 nt4.6□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 TIF5YPR041W 1218 nt4.6□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 CKS1YBR135W 453 nt4.6□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 MUP3YHL036W 1641 nt4.6□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 AZR1YGR224W 1842 nt4.6□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 LYP1YNL268W 1836 nt4.6□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 PRM2YIL037C 1971 nt4.6□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 OAF1YAL051W 3144 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 RMD1YDL001W 1293 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 PRP28YDR243C 1767 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YDR274CYDR274C 372 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 YGL118CYGL118C 438 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 KTR7YIL085C 1554 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 SWC3YAL011W 1878 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 CNA1YLR433C 1662 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 HSP82YPL240C 2130 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 BSD2YBR290W 966 nt4.59□□□□□ -1.67
VPS54Q12071 TYW1YPL207W 2433 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 PFK1YGR240C 2964 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 VBA2YBR293W 1425 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YGR079WYGR079W 1113 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YIL152WYIL152W 708 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 LTO1YNL260C 597 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 BUD17YNR027W 954 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 KEX1YGL203C 2190 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YGR266WYGR266W 2106 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 MCM2YBL023C 2607 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 BOP2YLR267W 1713 nt4.58□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 snR57snR57 88 nt4.57□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 MRT4YKL009W 711 nt4.57□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YBL081WYBL081W 1107 nt4.57□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 AIM41YOR215C 558 nt4.57□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YER158CYER158C 1722 nt4.57□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 TRM44YPL030W 1704 nt4.57□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 MDL1YLR188W 2088 nt4.57□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 STR2YJR130C 1920 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 PHO12YHR215W 1404 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 PHO11YAR071W 1404 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 RIP1YEL024W 648 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 NAT2YGR147C 867 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YIL163CYIL163C 354 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 CYC1YJR048W 330 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 RFU1YLR073C 603 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 ELO3YLR372W 1038 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YLR374CYLR374C 390 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YML119WYML119W 1074 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 RPL15BYMR121C 615 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YBR219CYBR219C 384 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YMR221CYMR221C 1515 nt4.56□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 MDM30YLR368W 1797 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YGR015CYGR015C 987 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 SNL1YIL016W 480 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YIL086CYIL086C 309 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YRA2YKL214C 612 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 RRN9YMR270C 1098 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YMR315WYMR315W 1050 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 YOR379CYOR379C 339 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 IMD2YHR216W 1572 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 GRC3YLL035W 1899 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 GSY1YFR015C 2127 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 MNN4YKL201C 3537 nt4.55□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 RIM21YNL294C 1602 nt4.54□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 TAF10YDR167W 621 nt4.54□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 RNA15YGL044C 891 nt4.54□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 FRA2YGL220W 363 nt4.54□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 ORM2YLR350W 651 nt4.54□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 FBP1YLR377C 1047 nt4.54□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 RER1YCL001W 567 nt4.54□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 FOX2YKR009C 2703 nt4.54□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 HOM3YER052C 1584 nt4.53□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 SPT3YDR392W 1014 nt4.53□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 ERG26YGL001C 1050 nt4.53□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 NKP2YLR315W 462 nt4.53□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 POL12YBL035C 2118 nt4.53□□□□□ -1.68
VPS54Q12071 STB3YDR169C 1542 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 RNY1YPL123C 1305 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 CTT1YGR088W 1689 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YDR249CYDR249C 1122 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 COX18YGR062C 951 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YLR326WYLR326W 723 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YIM1YMR152W 1098 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 MFM1YPL060W 1242 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 PHM7YOL084W 2976 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 MDM34YGL219C 1380 nt4.52□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 FDC1YDR539W 1512 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YIL001WYIL001W 1542 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 GDH2YDL215C 3279 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 PAH1YMR165C 2589 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 OCA4YCR095C 1089 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 COS7YDL248W 1152 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 LPP1YDR503C 825 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YER067C-AYER067C-A 324 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 GPP1YIL053W 753 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 COS5YJR161C 1152 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 YBL010CYBL010C 843 nt4.51□□□□□ -1.69
VPS54Q12071 RRP40YOL142W 723 nt4.51□□□□□ -1.69
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