Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOBRQ0VD83 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBRQ0VD83 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBRQ0VD83 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms