Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF543Q08ER8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF543Q08ER8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF543Q08ER8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms