Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PUDPQ08623 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PUDPQ08623 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms