Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PPP3CAQ08209 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP3CAQ08209 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms