Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC3A1Q07837 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC3A1Q07837 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC3A1Q07837 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC3A1Q07837 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC3A1Q07837 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC3A1Q07837 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC3A1Q07837 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC3A1Q07837 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC3A1Q07837 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC3A1Q07837 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms