Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4BQ07343 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4BQ07343 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms