Protein–RNA interactions for Protein: Q06702

CDA1, Chitin deacetylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDA1Q06702 YJL218WYJL218W 591 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 FIP1YJR093C 984 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 MMM1YLL006W 1281 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YLR379WYLR379W 375 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 RAS1YOR101W 930 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 HSP26YBR072W 645 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 RBA50YDR527W 1320 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 COM2YER130C 1332 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SHE10YGL228W 1734 nt5.36□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 TIP20YGL145W 2106 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 CCZ1YBR131W 2115 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 THI22YPR121W 1719 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PUT1YLR142W 1431 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YDR056CYDR056C 618 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SPT3YDR392W 1014 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PRE1YER012W 597 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YGR022CYGR022C 330 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SDS3YIL084C 984 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 GAT3YLR013W 426 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 snR3snR3 194 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PDB1YBR221C 1101 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 FRE3YOR381W 2136 nt5.35□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 VBA1YMR088C 1689 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YGR149WYGR149W 1299 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 PAN6YIL145C 930 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SYN8YAL014C 768 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 CPR7YJR032W 1182 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YKL202WYKL202W 582 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YKR041WYKR041W 753 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SUE1YPR151C 621 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 ARA1YBR149W 1035 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 SPP381YBR152W 876 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt5.34□□□□□ -1.55
CDA1Q06702 FOL1YNL256W 2475 nt5.34□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 OXP1YKL215C 3861 nt5.34□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 RNR3YIL066C 2610 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 IFM1YOL023W 2031 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 SAS10YDL153C 1833 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 KIN28YDL108W 921 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 SCM3YDL139C 672 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 MRPL49YJL096W 486 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 PAU17YLL025W 375 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ATG34YOL083W 1239 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YBR287WYBR287W 1284 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 HRP1YOL123W 1605 nt5.33□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YFR045WYFR045W 930 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 VAM7YGL212W 951 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 SNF8YPL002C 702 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 RPS9BYBR189W 588 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 snR44snR44 211 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 EKI1YDR147W 1605 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 SAG1YJR004C 1953 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ECM3YOR092W 1842 nt5.32□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 CTF13YMR094W 1437 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 DPH2YKL191W 1605 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 RRN3YKL125W 1884 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 GCS1YDL226C 1059 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 CTH1YDR151C 978 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YDR154CYDR154C 351 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 AIM39YOL053W 1188 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YPR195CYPR195C 330 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 MUD1YBR119W 897 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 DED81YHR019C 1665 nt5.31□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YDR444WYDR444W 2064 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 NOT3YIL038C 2511 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ATE1YGL017W 1512 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 CBP1YJL209W 1965 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 IWR1YDL115C 1062 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 RPL22BYFL034C-A 369 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YGR176WYGR176W 348 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 EFM4YIL064W 774 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 LDB18YLL049W 540 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 SRT1YMR101C 1032 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 UBC4YBR082C 447 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YBR116CYBR116C 528 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 DBF4YDR052C 2115 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 SNT2YGL131C 4212 nt5.3□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 YTM1YOR272W 1383 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 BRF1YGR246C 1791 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ZRC1YMR243C 1329 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ACC1YNR016C 6702 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 TOS4YLR183C 1470 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ADY2YCR010C 852 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 ARP2YDL029W 1176 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 HSP42YDR171W 1128 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 HTB1YDR224C 396 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 MLC1YGL106W 450 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt5.29□□□□□ -1.56
CDA1Q06702 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.6 ms