Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAD51Q06609 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAD51Q06609 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms