Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KDSRQ06136 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KDSRQ06136 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms