Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPN11Q06124 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN11Q06124 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms