Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CALD1Q05682 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CALD1Q05682 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms