Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRSF11Q05519 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRSF11Q05519 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms