Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EMX2Q04743 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms