Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EMX1Q04741 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMX1Q04741 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms