Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	ROT1	YMR200W	771 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	POP3	YNL282W	588 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YOR379C	YOR379C	339 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	YPL278C	YPL278C	303 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	DSS4	YPR017C	432 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	ADY3	YDL239C	2373 nt		3.34	□□□□□ -1.87
YMR090W	Q04304	CEG1	YGL130W	1380 nt		3.34	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	SWH1	YAR042W	3567 nt		3.34	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	GAS4	YOL132W	1416 nt		3.34	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	LYP1	YNL268W	1836 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YLR156W	YLR156W	345 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YLR157W-D	YLR157W-D	213 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YLR159W	YLR159W	345 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YLR161W	YLR161W	345 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	ASC1	YMR116C	960 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YNG1	YOR064C	660 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	IDI1	YPL117C	867 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	ERG4	YGL012W	1422 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	RSC58	YLR033W	1509 nt		3.33	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	NRK1	YNL129W	723 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	PUT2	YHR037W	1728 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	IKS1	YJL057C	2004 nt		3.32	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	NTH1	YDR001C	2256 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	VPS45	YGL095C	1734 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YEH2	YLR020C	1617 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YMR105W-A	YMR105W-A	195 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YPT53	YNL093W	663 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YBR016W	YBR016W	387 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	MFM1	YPL060W	1242 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	RER1	YCL001W	567 nt		3.31	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	SAT4	YCR008W	1812 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	MSK1	YNL073W	1731 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	TRK1	YJL129C	3708 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	AVT7	YIL088C	1473 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	SPT6	YGR116W	4356 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	IOC2	YLR095C	2439 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	HMG1	YML075C	3165 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YGL088W	YGL088W	366 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YGL199C	YGL199C	471 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YJR112W-A	YJR112W-A	330 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	OAR1	YKL055C	837 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YLR154W-B	YLR154W-B	165 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	CCS1	YMR038C	750 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	MTC4	YBR255W	2085 nt		3.3	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	BCK2	YER167W	2556 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	TDA6	YPR157W	1404 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	RXT3	YDL076C	885 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	SPR28	YDR218C	1272 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	API2	YDR525W	330 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	ATG33	YLR356W	594 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	RRN9	YMR270C	1098 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	NUP159	YIL115C	4383 nt		3.29	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YDR230W	YDR230W	348 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YDR246W-A	YDR246W-A	201 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	SAE3	YHR079C-A	276 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	RPB3	YIL021W	957 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YAL056C-A	YAL056C-A	351 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YRA2	YKL214C	612 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	IES3	YLR052W	753 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	YNL296W	YNL296W	315 nt		3.28	□□□□□ -1.88
YMR090W	Q04304	UBP7	YIL156W	3216 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	KRE28	YDR532C	1158 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	tR(ACG)J	tR(ACG)J	73 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	YIL171W-A	YIL171W-A	453 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	YJL220W	YJL220W	453 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	TAF11	YML015C	1041 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	RPL15B	YMR121C	615 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	YNR061C	YNR061C	660 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	STU1	YBL034C	4542 nt		3.27	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	ECM16	YMR128W	3804 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	IFM1	YOL023W	2031 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	PRP19	YLL036C	1512 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	IDP2	YLR174W	1239 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	PNP1	YLR209C	936 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	YLR364C-A	YLR364C-A	123 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	YBL036C	YBL036C	774 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	MRM1	YOR201C	1239 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	RMI1	YPL024W	726 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	SLX1	YBR228W	915 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	GDH2	YDL215C	3279 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	SEC2	YNL272C	2280 nt		3.26	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	GCN5	YGR252W	1320 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	ELM1	YKL048C	1923 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	SAF1	YBR280C	1914 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	BUD25	YER014C-A	462 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	YJR038C	YJR038C	363 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	ELF1	YKL160W	438 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	PER33	YLR064W	822 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	SWC7	YLR385C	399 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	ADD37	YMR184W	597 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	YTM1	YOR272W	1383 nt		3.25	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	OSH2	YDL019C	3852 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	GPI10	YGL142C	1851 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	FLC1	YPL221W	2382 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	RDH54	YBR073W	2877 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	EKI1	YDR147W	1605 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	PRP11	YDL043C	801 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	HOM2	YDR158W	1098 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	LPP1	YDR503C	825 nt		3.24	□□□□□ -1.89
YMR090W	Q04304	SPO73	YER046W	432 nt		3.24	□□□□□ -1.89

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.4 ms