Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RELAQ04206 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RELAQ04206 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RELAQ04206 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RELAQ04206 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELAQ04206 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELAQ04206 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELAQ04206 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELAQ04206 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELAQ04206 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RELAQ04206 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RELAQ04206 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RELAQ04206 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RELAQ04206 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RELAQ04206 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RELAQ04206 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RELAQ04206 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms