Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NUCB1Q02818 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUCB1Q02818 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUCB1Q02818 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NUCB1Q02818 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUCB1Q02818 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms