Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GCNT1Q02742 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCNT1Q02742 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCNT1Q02742 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms