Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
OC90Q02509 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
OC90Q02509 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
OC90Q02509 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
OC90Q02509 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
OC90Q02509 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
OC90Q02509 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
OC90Q02509 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
OC90Q02509 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms