Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SATB1Q01826 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SATB1Q01826 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SATB1Q01826 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms