Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
EXOSC10Q01780 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EXOSC10Q01780 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EXOSC10Q01780 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms