Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK17Q00537 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDK17Q00537 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDK17Q00537 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms