Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GTF2BQ00403 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF2BQ00403 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms