Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXA4Q00056 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA4Q00056 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA4Q00056 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA4Q00056 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA4Q00056 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA4Q00056 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA4Q00056 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HOXA4Q00056 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms