Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD1P98174 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGD1P98174 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGD1P98174 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
FGD1P98174 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
FGD1P98174 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGD1P98174 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGD1P98174 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGD1P98174 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGD1P98174 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGD1P98174 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGD1P98174 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD1P98174 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD1P98174 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD1P98174 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD1P98174 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD1P98174 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD1P98174 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGD1P98174 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGD1P98174 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FGD1P98174 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FGD1P98174 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FGD1P98174 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FGD1P98174 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms