Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKOR1P84550 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKOR1P84550 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms