Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFI35P80217 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFI35P80217 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IFI35P80217 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFI35P80217 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFI35P80217 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFI35P80217 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFI35P80217 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFI35P80217 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFI35P80217 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFI35P80217 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFI35P80217 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFI35P80217 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFI35P80217 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFI35P80217 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFI35P80217 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFI35P80217 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFI35P80217 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFI35P80217 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFI35P80217 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFI35P80217 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFI35P80217 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFI35P80217 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms