Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITX1P78337 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITX1P78337 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITX1P78337 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITX1P78337 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX1P78337 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX1P78337 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX1P78337 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX1P78337 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX1P78337 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITX1P78337 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITX1P78337 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITX1P78337 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITX1P78337 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITX1P78337 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITX1P78337 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITX1P78337 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITX1P78337 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITX1P78337 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITX1P78337 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms