Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TPM4P67936 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TPM4P67936 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TPM4P67936 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM4P67936 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM4P67936 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM4P67936 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM4P67936 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM4P67936 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TPM4P67936 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM4P67936 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM4P67936 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM4P67936 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TPM4P67936 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TPM4P67936 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM4P67936 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM4P67936 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM4P67936 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM4P67936 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM4P67936 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM4P67936 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TPM4P67936 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TPM4P67936 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TPM4P67936 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TPM4P67936 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TPM4P67936 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms