Protein–RNA interactions for Protein: P67775

PPP2CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CAP67775 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP2CAP67775 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP2CAP67775 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms