Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SUMO1P63165 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms