Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HERVK_113P63132 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113P63132 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms