Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNG7P62955 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNG7P62955 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms