Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RHOBP62745 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOBP62745 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOBP62745 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOBP62745 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RHOBP62745 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOBP62745 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOBP62745 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RHOBP62745 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RHOBP62745 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RHOBP62745 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms