Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HERVK_113P62684 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HERVK_113P62684 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms