Protein–RNA interactions for Protein: P62277

RPS13, 40S ribosomal protein S13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS13P62277 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS13P62277 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS13P62277 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS13P62277 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS13P62277 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS13P62277 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS13P62277 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS13P62277 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS13P62277 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS13P62277 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS13P62277 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS13P62277 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS13P62277 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS13P62277 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS13P62277 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS13P62277 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS13P62277 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS13P62277 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS13P62277 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS13P62277 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS13P62277 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPS13P62277 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPS13P62277 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPS13P62277 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPS13P62277 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPS13P62277 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms