Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NCS1P62166 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NCS1P62166 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NCS1P62166 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NCS1P62166 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NCS1P62166 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCS1P62166 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCS1P62166 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCS1P62166 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCS1P62166 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCS1P62166 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCS1P62166 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms