Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
EIF4A1P60842 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EIF4A1P60842 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EIF4A1P60842 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms