Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHBDL3P58872 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHBDL3P58872 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms