Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
LINC01547P58512 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
LINC01547P58512 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms